За экологической безопасностью следят на Брянском отделении Московской железной дороги. Для этого на отделении существует природоохранная структура, состоящая из сектора охраны природы и производственной лаборатории. На территории Брянского отделения 24 структурных подразделения, в том числе — 7 дорожного подчинения, расположенных на 167 промышленных площадках Брянской и Калужской областей.

Кроме мероприятий по охране природы и оздоровлению окружающей среды, производственная лаборатория самостоятельно разрабатывает нормативную экологическую документацию. Разработка такой документации и система производственного контроля позволили обеспечить не только экологический, но и экономический эффект — экономия эксплутационных затрат составила в 2006 году более чем 2,5 миллиона рублей, а за девять месяцев 2007 года — 6 миллионов 724 тысячи рублей.