Специалисты ЦНИИ эпидемиологии Роспотребнадзора предложили быстрый и недорогой метод контроля за мутациями коронавируса, который может стать альтернативой более сложной процедуре полной расшифровки генома, применяемой сейчас для мониторинга за мутациями и штаммами. Они предлагают «прочитывать» только его «важную» часть и использовать для этого целенаправленное высокопроизводительное секвенирование гена, кодирующего S-гликопротеин SARS-CoV-2. 

С использованием подготовленного набора праймеров ученые из проанализировали геномные последовательности у 579 инфицированных коронавирусом жителей Москвы и области с февраля по июнь 2021 года. Пробы участников были взяты с помощью мазков из носоглотки и с их согласия доставлены в ЦНИИ эпидемиологии Роспотребнадзора. Результаты анализа показали, что уже в конце мая распространенность штамма «дельта» в столичном регионе по предварительным оценкам достигла 60-70%, что совпадает с официальными данными, опубликованными руководством города в июне. Об этом сообщают «Известия».

Исследования показали, как начиная с апреля вирусы с мутациями E484K, S494P и N501Y, характерными для «южноафриканского» и «бразильского» штаммов, были вытеснены вирусами с изменениями K417N, L452R и T478K, типичными для штамма «дельта». Таким образом ученым удалось подтвердить, что небольшого набора праймеров и последующей расшифровки соответствующих им генов достаточно, чтобы обнаружить практически все значимые мутации в S-белке.